في مستقبل أصبحت فيه الإنترنت جزءًا أساسيًا من الحياة، يتلقى نيتو هيكاري مساعدًا رقميًا خاصًا يُدعى ميجامان. ويتعاون الاثنان مع أصدقائهما لمحاربة الفيروسات وإيقاف المنظمات التي تهدد العالم عبر الشبكة.